Istraživanja proteoma zahtijevaju više od jednostavne identifikacije. Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ softver pojednostavljuje identifikaciju i kvantifikaciju proteina u kompleksnim biološkim uzorcima i podržava širok opseg proteomičkih pristupa.
Mogućnosti obuhvataju identifikaciju proteina i peptida, analizu posttranslacijskih modifikacija i izobarsko obilježavanje mase, kao i SILAC i LFQ metodologije (SILAC – stable isotope labeling by amino acids in cell culture; LFQ – label-free quantitation).